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首页 » 常识 » 预防 » 再取进展深圳团队的测序研究,揭示新冠重症
TUhjnbcbe - 2024/9/11 1:27:00
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当前,新冠肺炎(COVID-19)已经全球大流行,根据最新统计数据(/05/12),肺炎疫情已经蔓延至个国家和地区,导致超过万人感染,28万人死亡。尽管从目前数据看来,新冠肺炎致死率没有SARS严重。但是对于老年人,特别是合并高血压、糖尿病等,依旧容易发展成为重症甚至危重症。目前研究尚无法阐释为什么有些患者发展成重症,而另一些则是轻度、中度甚至无症状携带者。尽管有研究发现冠状病毒诱导的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的免疫发病机制可能包括干扰素异常、高炎症反应和细胞因子风暴、中和抗体的无效或延迟诱导的特异性T细胞反应。然而,由于生物安全和伦理问题以及技术上的局限性,目前的认识大多源于动物模型研究,而不是直接来源于人类。尽管有研究认为淋巴细胞减少是COVID-19重症的一个显著特征,但目前对SARS-CoV-2感染人类的潜在免疫反应机制尚不清楚,相关的疾病保护或致病机制,尤其是疾病重症化的机制也尚待研究。年5月12日,国家感染性疾病临床医学研究中心(南方医院/医院)张政课题组联合复旦大学附属上海市公共卫生中心章树业团队、以色列魏兹曼研究所IdoAmit团队以及医院刘磊教授合作在NatureMedicine杂志在线发表题为Single-celllandscapeofbronchoalveolarimmunecellsinpatientswithCOVID-19的研究论文。该研究描绘了与新冠肺炎COVID-19严重程度相关的肺泡灌洗液(BALF)免疫细胞特征,为理解COVID-19重症化免疫学机制提供了重要研究数据,为寻找疾病的免疫干预策略提供了重要线索。在该研究中,研究团队应用单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)技术,对9例COVID-19患者(包括6例重症/危重患者和3例普通型患者)和4例健康人的支气管肺泡灌洗液(BALF)细胞进行了整合分析。图.研究方案示意图研究结果发现COVID-19患者中出现巨噬细胞特异性富集。重症/危重症患者肺泡灌洗液中巨噬细胞和中性粒细胞比例比普通型升高,但是髓样树突状细胞(mDCs)、浆细胞样树突状细胞(pDCs)和T细胞比例较普通型患者减少。再进一步对巨噬细胞进行研究发现,重症/危重症患者中,单核细胞来源的巨噬细胞(FCN1+巨噬细胞)增多,并且逐渐取代组织内的肺泡巨噬细胞。这些单核细胞来源的巨噬细胞具有高度的炎症性,产生与细胞因子风暴有关的多种细胞因子(IL-8、IL-6和IL-1β)。此外,研究人员还对T淋巴细胞和NK细胞进行了研究,结果发现重症/危重症患者的CD8+T细胞和增殖性T细胞比例低于普通型患者。这些CD8+T细胞在普通型患者中参与细胞激活、迁移和细胞因子相关途径的基因上调,而在重症患者的CD8+T细胞中上调的基因则参与翻译启动,细胞稳态和核苷酸代谢等。研究人员进一步整合TCR数据,结果发现普通型患者中具有组织定植性特征的高度扩增的克隆性CD8+T细胞的形成,这表明一种强大的适应性免疫反应参与控制COVID-19的病理改变。图.COVID-19患者T细胞与TCR分析综上所述,该研究通过绘制支气管肺泡免疫微环境图谱,发现重症COVID-9患者BALF中富含促炎性单核细胞源性巨噬细胞;而普通型患者中却以定植CD8+T细胞高度克隆性扩增为特征。该研究是国际上首次在单细胞层面对新冠肺炎组织原位(支气管肺泡灌洗液)进行深度分析研究,这可以为提示COVID-19重症化发病机制以及可能的保护机制提供科学依据。NatureMedicine也对该研究进行了特别宣传报道。国家感染性疾病临床医学研究中心(医院/南方医院)张政课题组致力于人类重要脏器(肝、肺、脾等)以及重大传染病(包括艾滋,乙肝、冠状病毒感染)的单细胞系统免疫学研究,近期利用scRNA-seq技术解析了肝脏常驻免疫细胞(LrICs)的单细胞图谱,发现CXCR6+的T和NK细胞亚群是肝脏中富集的主要淋巴细胞亚群,并表现出组织特异性功能和明显的稳态增殖。解析人类LrICs的异质性和功能多样性,将有助于进一步揭示其在各种肝脏疾病(如乙型肝炎、肝硬化和肝移植等)中的作用。在重大传染性疾病研究中张政课题组揭示了HIV感染中IFN-I的免疫致病新机理,为研发阻遏HIV感染者体内MAIT细胞功能、降低HIV感染者易感结核提供了新的治疗策略。在新冠病毒研究中,该团队利用scRNA-seq技术分析了人个人冠状病毒受体和膜蛋白在13个人体组织个细胞类型中的表达,发现ANPEP(人冠状病毒E受体)、ENPEP、DPP4(MERS-CoV受体)和ACE2在体内各组织器官中的分布高度一致,并提示巨噬细胞是与病毒感染靶细胞相互作用网络的关键节点,突出了组织巨噬细胞在免疫防御和致病中的潜在作用。据悉,该项研究由国家感染性疾病临床医学研究中心(南方医院/医院)、上海市(复旦大学附属)公共卫生中心、以色列魏兹曼研究所等机构合作完成。医院刘磊教授、以色列魏兹曼研究所IdoAmit教授、上海市(复旦大学附属)公共卫生中心章树业教授、医院张政教授为本文通讯作者。医院助理研究员廖明凤、助理研究员刘阳、袁静博士为本文的共同第一作者。值得一提的是,该课题组另一篇关于关于新冠病毒-宿主反应的姊妹篇研究成果于今日同步在Cell上线,详见今日BioArtReports头条报道。
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